MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methylophaga sp. JAM7 plasmid unnamed

Total Repeats: 817

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017858	CTT	2	6	63	68	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387128926
2	NC_017858	TTC	2	6	133	138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387128926
3	NC_017858	GCG	2	6	148	153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387128926
4	NC_017858	AGC	2	6	193	198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387128926
5	NC_017858	GCA	2	6	225	230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387128926
6	NC_017858	CAG	2	6	270	275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387128926
7	NC_017858	TTGT	2	8	312	319	0 %	75 %	25 %	0 %	387128926
8	NC_017858	CGC	2	6	399	404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387128927
9	NC_017858	TCG	3	9	435	443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387128927
10	NC_017858	TAA	2	6	532	537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387128927
11	NC_017858	GCC	2	6	603	608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387128927
12	NC_017858	CCT	2	6	628	633	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387128927
13	NC_017858	CTTG	2	8	678	685	0 %	50 %	25 %	25 %	387128927
14	NC_017858	CAA	2	6	709	714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387128927
15	NC_017858	GCA	2	6	730	735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387128927
16	NC_017858	GGC	2	6	795	800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387128927
17	NC_017858	GCG	2	6	816	821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387128927
18	NC_017858	GCC	2	6	909	914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387128927
19	NC_017858	ACA	3	9	1071	1079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387128927
20	NC_017858	GCC	2	6	1190	1195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387128927
21	NC_017858	CAGC	2	8	1297	1304	25 %	0 %	25 %	50 %	387128927
22	NC_017858	TCG	2	6	1323	1328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387128927
23	NC_017858	GGC	2	6	1337	1342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387128927
24	NC_017858	TC	3	6	1362	1367	0 %	50 %	0 %	50 %	387128927
25	NC_017858	CAT	2	6	1373	1378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387128927
26	NC_017858	CT	3	6	1470	1475	0 %	50 %	0 %	50 %	387128928
27	NC_017858	CGG	2	6	1511	1516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387128928
28	NC_017858	CGG	2	6	1529	1534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387128928
29	NC_017858	AAC	2	6	1552	1557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387128928
30	NC_017858	CGC	2	6	1572	1577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387128928
31	NC_017858	GTA	2	6	1653	1658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387128928
32	NC_017858	CCG	2	6	1660	1665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387128928
33	NC_017858	CGC	2	6	1745	1750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387128928
34	NC_017858	GCA	2	6	1774	1779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387128928
35	NC_017858	GCG	2	6	1794	1799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387128928
36	NC_017858	TTC	2	6	2003	2008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387128929
37	NC_017858	GCTCCT	2	12	2019	2030	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	387128929
38	NC_017858	TTC	2	6	2089	2094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387128929
39	NC_017858	CAG	2	6	2100	2105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387128929
40	NC_017858	CAA	2	6	2133	2138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387128929
41	NC_017858	CT	3	6	4079	4084	0 %	50 %	0 %	50 %	387128930
42	NC_017858	CTT	2	6	4123	4128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387128930
43	NC_017858	TG	3	6	4194	4199	0 %	50 %	50 %	0 %	387128930
44	NC_017858	AGT	2	6	4206	4211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387128930
45	NC_017858	GCG	2	6	4219	4224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387128930
46	NC_017858	TAG	2	6	4271	4276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387128930
47	NC_017858	TCA	2	6	4304	4309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387128930
48	NC_017858	TAGTGA	2	12	4369	4380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387128930
49	NC_017858	GAC	2	6	4386	4391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387128930
50	NC_017858	GTA	2	6	4459	4464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387128930
51	NC_017858	ACC	2	6	4479	4484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387128930
52	NC_017858	TCT	2	6	4583	4588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387128930
53	NC_017858	GCTC	2	8	4647	4654	0 %	25 %	25 %	50 %	387128930
54	NC_017858	GTTT	2	8	4677	4684	0 %	75 %	25 %	0 %	387128930
55	NC_017858	GT	3	6	4796	4801	0 %	50 %	50 %	0 %	387128930
56	NC_017858	GCC	2	6	4811	4816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387128930
57	NC_017858	CTTT	2	8	4860	4867	0 %	75 %	0 %	25 %	387128930
58	NC_017858	CTT	2	6	4876	4881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387128930
59	NC_017858	CGT	2	6	4917	4922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387128930
60	NC_017858	GTG	2	6	4931	4936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387128930
61	NC_017858	GTTG	2	8	4948	4955	0 %	50 %	50 %	0 %	387128930
62	NC_017858	TCGCC	2	10	5004	5013	0 %	20 %	20 %	60 %	387128930
63	NC_017858	ACC	2	6	5098	5103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387128930
64	NC_017858	T	6	6	5114	5119	0 %	100 %	0 %	0 %	387128930
65	NC_017858	AT	3	6	5120	5125	50 %	50 %	0 %	0 %	387128930
66	NC_017858	TTG	2	6	5128	5133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387128930
67	NC_017858	GTC	2	6	5140	5145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387128930
68	NC_017858	AATC	2	8	5238	5245	50 %	25 %	0 %	25 %	387128931
69	NC_017858	GCA	2	6	5354	5359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387128931
70	NC_017858	GTCC	2	8	5398	5405	0 %	25 %	25 %	50 %	387128931
71	NC_017858	CTTG	2	8	5409	5416	0 %	50 %	25 %	25 %	387128931
72	NC_017858	ACT	2	6	5467	5472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387128931
73	NC_017858	GCC	2	6	5473	5478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387128931
74	NC_017858	TGT	2	6	5532	5537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387128931
75	NC_017858	TGC	2	6	5671	5676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387128932
76	NC_017858	TGA	2	6	5684	5689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387128932
77	NC_017858	GAAC	2	8	5705	5712	50 %	0 %	25 %	25 %	387128932
78	NC_017858	AAC	2	6	5756	5761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387128932
79	NC_017858	CGC	2	6	5818	5823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387128932
80	NC_017858	CAG	2	6	5905	5910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387128932
81	NC_017858	TGTGC	2	10	5925	5934	0 %	40 %	40 %	20 %	387128932
82	NC_017858	AAG	2	6	5961	5966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387128932
83	NC_017858	GAA	2	6	5973	5978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387128932
84	NC_017858	A	7	7	5984	5990	100 %	0 %	0 %	0 %	387128932
85	NC_017858	CA	3	6	6008	6013	50 %	0 %	0 %	50 %	387128932
86	NC_017858	AAAG	2	8	6321	6328	75 %	0 %	25 %	0 %	387128933
87	NC_017858	AAGC	2	8	6526	6533	50 %	0 %	25 %	25 %	387128933
88	NC_017858	CCT	2	6	6587	6592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387128933
89	NC_017858	CCG	2	6	6678	6683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387128933
90	NC_017858	GCA	2	6	6713	6718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387128933
91	NC_017858	CGG	2	6	6739	6744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387128933
92	NC_017858	TCA	2	6	6822	6827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387128933
93	NC_017858	CA	3	6	6878	6883	50 %	0 %	0 %	50 %	387128933
94	NC_017858	CTG	2	6	6908	6913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387128933
95	NC_017858	AAC	2	6	6916	6921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387128933
96	NC_017858	GCGGA	2	10	6963	6972	20 %	0 %	60 %	20 %	387128933
97	NC_017858	GCG	2	6	7014	7019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387128933
98	NC_017858	CAA	2	6	7036	7041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387128933
99	NC_017858	CTGGC	2	10	7050	7059	0 %	20 %	40 %	40 %	387128933
100	NC_017858	GGT	2	6	7126	7131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387128933
101	NC_017858	GTT	2	6	7139	7144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387128933
102	NC_017858	GCC	2	6	7167	7172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387128933
103	NC_017858	ACTC	2	8	7269	7276	25 %	25 %	0 %	50 %	387128934
104	NC_017858	TCCA	3	12	7278	7289	25 %	25 %	0 %	50 %	387128934
105	NC_017858	GGC	2	6	7381	7386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387128934
106	NC_017858	CAT	2	6	7458	7463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387128934
107	NC_017858	GTC	2	6	7471	7476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387128934
108	NC_017858	GGC	2	6	7480	7485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387128934
109	NC_017858	CTT	2	6	7515	7520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387128934
110	NC_017858	CTG	2	6	7555	7560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387128934
111	NC_017858	ATG	2	6	7576	7581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387128934
112	NC_017858	CTT	2	6	7587	7592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387128934
113	NC_017858	GTG	2	6	7598	7603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387128934
114	NC_017858	ACTG	2	8	7617	7624	25 %	25 %	25 %	25 %	387128934
115	NC_017858	GCG	2	6	7646	7651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387128934
116	NC_017858	CTG	2	6	7782	7787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387128935
117	NC_017858	TG	3	6	7865	7870	0 %	50 %	50 %	0 %	387128935
118	NC_017858	CCG	2	6	7922	7927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387128935
119	NC_017858	GCA	2	6	7951	7956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387128935
120	NC_017858	ACA	2	6	7974	7979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387128935
121	NC_017858	ATG	2	6	8000	8005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387128935
122	NC_017858	TGCGG	2	10	8036	8045	0 %	20 %	60 %	20 %	387128936
123	NC_017858	GCTG	2	8	8128	8135	0 %	25 %	50 %	25 %	387128936
124	NC_017858	TGT	2	6	8155	8160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387128936
125	NC_017858	TGA	2	6	8161	8166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387128936
126	NC_017858	CGT	2	6	8202	8207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387128936
127	NC_017858	GAC	2	6	8222	8227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387128936
128	NC_017858	CAG	2	6	8233	8238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387128936
129	NC_017858	CGA	2	6	8242	8247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387128936
130	NC_017858	CTG	2	6	8483	8488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387128936
131	NC_017858	A	6	6	8543	8548	100 %	0 %	0 %	0 %	387128936
132	NC_017858	ACT	2	6	8612	8617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387128936
133	NC_017858	AGA	2	6	8646	8651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387128936
134	NC_017858	GCA	2	6	8667	8672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387128936
135	NC_017858	GCTG	2	8	8697	8704	0 %	25 %	50 %	25 %	387128936
136	NC_017858	CAA	2	6	8746	8751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387128936
137	NC_017858	CTTCAT	2	12	8926	8937	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	387128936
138	NC_017858	AAG	2	6	8978	8983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387128936
139	NC_017858	GTC	3	9	9134	9142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387128936
140	NC_017858	GCC	2	6	9294	9299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387128936
141	NC_017858	CTG	2	6	9329	9334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387128936
142	NC_017858	CCG	2	6	9360	9365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387128936
143	NC_017858	CCGTT	2	10	9434	9443	0 %	40 %	20 %	40 %	387128936
144	NC_017858	AC	3	6	9509	9514	50 %	0 %	0 %	50 %	387128936
145	NC_017858	CCG	2	6	9538	9543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387128936
146	NC_017858	CGG	2	6	9610	9615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387128936
147	NC_017858	AATGG	2	10	9703	9712	40 %	20 %	40 %	0 %	387128936
148	NC_017858	CGCC	2	8	9750	9757	0 %	0 %	25 %	75 %	387128936
149	NC_017858	GAAAT	2	10	9762	9771	60 %	20 %	20 %	0 %	387128936
150	NC_017858	TC	3	6	9825	9830	0 %	50 %	0 %	50 %	387128936
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152	NC_017858	CAC	2	6	9940	9945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387128936
153	NC_017858	TGA	2	6	9963	9968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387128936
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155	NC_017858	CCG	2	6	10012	10017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387128936
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158	NC_017858	TGC	2	6	10125	10130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387128936
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165	NC_017858	GGT	2	6	10710	10715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387128937
166	NC_017858	TCA	2	6	10717	10722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387128937
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248	NC_017858	GCCA	2	8	15198	15205	25 %	0 %	25 %	50 %	387128943
249	NC_017858	CTGG	2	8	15234	15241	0 %	25 %	50 %	25 %	387128943
250	NC_017858	T	6	6	15244	15249	0 %	100 %	0 %	0 %	387128943
251	NC_017858	GCA	2	6	15319	15324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387128943
252	NC_017858	CCT	2	6	15329	15334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387128943
253	NC_017858	ATT	2	6	15411	15416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387128943
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255	NC_017858	CCA	2	6	15535	15540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387128943
256	NC_017858	CT	3	6	15548	15553	0 %	50 %	0 %	50 %	387128943
257	NC_017858	AATT	2	8	15557	15564	50 %	50 %	0 %	0 %	387128943
258	NC_017858	GAT	2	6	15624	15629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387128943
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261	NC_017858	T	6	6	15691	15696	0 %	100 %	0 %	0 %	387128943
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388	NC_017858	A	6	6	22590	22595	100 %	0 %	0 %	0 %	387128952
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